无服务器跑生信分析电脑推荐_生信分析服务器配置

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生物信息分析的服务器多少钱一台

不同的地区,不同的经销商,不同的品牌,价格都不相同。

建议到官方销售点咨询。具体价位以官方销售点为准。

做生物信息学用什么配置的电脑?

自用的话,普通本就行了,关键是稳定。

至于内存,小规模计算2G4G都够了,跑大程序,多几个G也不够用。

有钱的话,实验室配个小型服务器,要是有cluster就更好啦。

用于做生物信息数据分析的笔记本电脑有推荐的吗,5

推荐如下:戴尔Inspiron 灵越 15 7000系列 微边框(INS15-7560-D1545S)

屏幕尺寸:15.6英寸 1920x1080

笔记本重量:2Kg

CPU型号:Intel 酷睿i5 7200U

CPU主频:2.5GHz

内存容量:4GB(4GB×1) DDR4 2400MHz

硬盘容量:128GB+500GB 5400转

显卡芯片:NVIDIA GeForce 940MX

学习生物信息学,需要配置怎样的电脑呢?

首先的问题的是,我们需要什么样的计算机。

关于硬件:

需要至少4G内存,最好可以达到16G以上内存;

至少500G硬盘空间。通常一个RNA-seq的数据量为20G左右,如果再加上分析之后的结果,可能达到50G,所以即使你有500G的空间,也分析不了几组数据。所以硬盘空间越多越好,比如说2TB或者使用高速网络存贮界质。

CPU,至少2核。因为你在运行程序时,通常100%占到CPU,如果没有2核,计算机多半会假死在那里。如果有8核,或者以上更好。

GPU,很多程序开始使用GPU运算,如果能有好的GPU显卡,也是推荐的,但不是必须的。

为了达到以上的条件,入门极的比如说Mac Pro。进阶级的就是独立server,高级的是supercomputer clusters,支持qsub之类的。或者可以购买云计算服务。

对于操作系统,在工作站方面,推荐Mac OS。它运行稳定,与LINUX同源。需要下载安装Xcode和wget就可以了。当然你还可以很方便的安装office办公软件,以及photoshop,AI等工具。最后安装好R/Bioconductor,就可以开始工作了。如果买了兼容机,可以安装上Linux/UNIX系统。它在安装上R/Bioconductor之后基本上就可以了。它的缺点是办公软件,绘图软件的安装。最差的就是Windows了。需要安装比如GCC编译器,make工具,mingw64, perl, zip/unzip, tar, wget, ghostscript等等。

有了软件及硬件,接下来的工作就是了解一些常识以武装你的大脑,这是整个运行环境中最重要的一环。首先,你需要学习了掌握UNIX常用命令,并且不反感字符界面。其次学会安装,设置及构建网络服务,比如apache的websever,以及mysql的数据库服务。第三安装及设置一个Galaxy。当然,第二步及第三步可能会有难度,可以先使用Galaxy本身的服务,但是它有很多限制,所以最好还是自己安装一个比较好。第四步,学习一门计算机语言,比如c, python, ruby, java等,还有一门脚本式语言工具,比如perl。第五步,学习使用R/Bioconductor。第六步,统计学。

至此,你的NGS分析环境就设置完成了。如果快的话,你可以两三个月就设置完成,达到起步的阶段,之后就是漫长的学习过程。慢的话,四年本科也不一定学到多少。

用于生物信息分析该如何安装ubuntu系统

1. 生信软件系统的选择——Linux(ubuntu)

对于生信分析人员来说,日常工作,软件运行,跑流程,均在linux下操作。当然,也有基于云端的生信分析平台,如免费的Galaxy,或者某些 公司的一站式云平台。

比较初学者学生物信息还是使用开源软件、学原理、一步一步运行才有意思。这路子,一定要适应Linux的命令行界面。

选择windows还是linux? 一定是linux,windows太多的生物软件不兼容了。

选择linux的哪个版本?推荐桌面版的Ubuntu——稳定,美观,适合初学者之称;次之,Centos——免费、稳定的服务器linux版本之称。

用那种方式安装linux好?推荐虚拟机安装。不太建议双系统,云端这种。因为,对于初学者在系统中,需要反复折腾,测试,搞垮系统是常事。

选择开源的VMbox还是商业版VMware?两者都可以,但各有缺点。VMbox更新比较快,经常更新后,可能会出现报错,系统无法打开的现象,较低版本的反而比较稳定,如果用好了,不建议经常更新。还有一点是,VMbox在鼠标控制上,没有VMware流畅。VMware十分稳定,流程好用。最新版一般要收费。可以选择比最新版版本稍低的,上网搜注册码,免费使用。还是那样,用好了,不要经常更新。某些生信软件会提供VMbox的镜像,如qiime。

VMbox的镜像能不能转到VMware上使用?,答案是可以的,使用VMbox的镜像导出功能,然后使用VMware进行导入,保持两者格式相同。

3条大神的评论

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    访客 2022-07-09 下午 03:22:31

    8GB+500GB 5400转显卡芯片:NVIDIA GeForce 940MX学习生物信息学,需要配置怎样的电脑呢?首先的问题的是,我们需要什么样的计算机。关于硬件:需要至少4G内存,最好可以达到16G以上内存;至少500G硬盘空间。通常一个RNA-seq的数据量为20G左右,如果再加上分析之

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    访客 2022-07-09 下午 02:19:23

    文章目录:1、生物信息分析的服务器多少钱一台2、做生物信息学用什么配置的电脑?3、用于做生物信息数据分析的笔记本电脑有推荐的吗,54、学习生物信息学,需要配置怎样的电脑呢?5、用于生物信息分析该如何安装ubuntu系统生物信息分析的服务器多少钱一台不同的地区,不同的经销商,不同的品牌

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    访客 2022-07-09 下午 01:39:07

    购买云计算服务。对于操作系统,在工作站方面,推荐Mac OS。它运行稳定,与LINUX同源。需要下载安装Xcode和wget就可以了。当然你还可以很方便的安装office办公软件,以及ph

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